Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms