Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Smg9Q9DB90 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms