Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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