Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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