Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms