Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Usp49Q6P9L4 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Usp49Q6P9L4 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Usp49Q6P9L4 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Usp49Q6P9L4 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Usp49Q6P9L4 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Usp49Q6P9L4 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp49Q6P9L4 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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