Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms