Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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