Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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Rpusd3Q14AI6 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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Rpusd3Q14AI6 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Rpusd3Q14AI6 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
Rpusd3Q14AI6 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Rpusd3Q14AI6 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Rpusd3Q14AI6 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms