Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SbdsP70122 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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