Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprkP35822 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PtprkP35822 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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