Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RxraP28700 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RxraP28700 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms