Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PrkcaP20444 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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