Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
H2-M1F7CXU4 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
H2-M1F7CXU4 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms