Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac6Q9Z2V5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Hdac6Q9Z2V5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac6Q9Z2V5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac6Q9Z2V5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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