Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3Q9Z2D8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3Q9Z2D8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms