Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn8Q9Z260 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn8Q9Z260 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms