Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ilf3Q9Z1X4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms