Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Setbp1Q9Z180 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Setbp1Q9Z180 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setbp1Q9Z180 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setbp1Q9Z180 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setbp1Q9Z180 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setbp1Q9Z180 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setbp1Q9Z180 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setbp1Q9Z180 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms