Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms