Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
S1pr4Q9Z0L1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
S1pr4Q9Z0L1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms