Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme3Q9WV85 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms