Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srd5a3Q9WUP4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srd5a3Q9WUP4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms