Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PplQ9R269 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PplQ9R269 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PplQ9R269 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PplQ9R269 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PplQ9R269 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PplQ9R269 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PplQ9R269 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PplQ9R269 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PplQ9R269 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms