Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms