Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TapbpQ9R233 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TapbpQ9R233 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms