Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf7Q9R1C0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf7Q9R1C0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms