Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zeb2Q9R0G7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms