Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnt3Q9QZ47 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnt3Q9QZ47 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms