Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Foxe3Q9QY14 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Foxe3Q9QY14 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Foxe3Q9QY14 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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