Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk1nQ9QXV0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk1nQ9QXV0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms