Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyth1Q9QX11 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyth1Q9QX11 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyth1Q9QX11 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyth1Q9QX11 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyth1Q9QX11 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyth1Q9QX11 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyth1Q9QX11 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cyth1Q9QX11 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cyth1Q9QX11 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms