Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg4Q9JM99 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prg4Q9JM99 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms