Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR1

Sec61a2, Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 2, mousemouse

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Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61a2Q9JLR1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec61a2Q9JLR1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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