Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd2apQ9JLQ0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd2apQ9JLQ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms