Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK3

Cabp5, Calcium-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp5Q9JLK3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cabp5Q9JLK3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cabp5Q9JLK3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms