Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms