Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms