Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cnga3Q9JJZ8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cnga3Q9JJZ8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms