Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gfra4Q9JJT2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms