Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc86Q9JJ89 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms