Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Praf2Q9JIG8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Praf2Q9JIG8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms