Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RabggtaQ9JHK4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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