Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc9Q9JHI7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc9Q9JHI7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms