Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc4Q9ES56 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc4Q9ES56 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms