Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ28

Pold3, DNA polymerase delta subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold3Q9EQ28 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pold3Q9EQ28 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pold3Q9EQ28 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms