Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hmgn3Q9DCB1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms