Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PmpcaQ9DC61 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PmpcaQ9DC61 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PmpcaQ9DC61 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PmpcaQ9DC61 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PmpcaQ9DC61 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PmpcaQ9DC61 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PmpcaQ9DC61 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PmpcaQ9DC61 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PmpcaQ9DC61 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PmpcaQ9DC61 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PmpcaQ9DC61 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PmpcaQ9DC61 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PmpcaQ9DC61 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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PmpcaQ9DC61 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PmpcaQ9DC61 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PmpcaQ9DC61 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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