Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hmg20aQ9DC33 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms