Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Swt1Q9DBQ9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms